Pues si es así, habla con los de Nóminas o RRHH de tu empresa. Son humanos y pueden equivocarse (o el programa de nóminas).
Dices que la empresa asume el pago de la prestación, imagino que no por pago delegado sino como empresa colaboradora (o sea asume el coste de las prestaciones, pero tambien se deduce un % de las cotizaciones) pero aún así, si estas de baja, deberías seguir arrastrando la base reguladora. Tal vez, por no complicarse, ya que asumen el 100% de la presatación, ni siquiera te aparece la prestación de IT en nómina (y hasta el 100% de salarios como complementos) sino que te aparece un desglose de conceptos normal, como si no estuvieras de baja. Claro, si tu IT no ha afectado el desglose de conceptos salariales, posiblemente no hayan reparado (o no tengan el rpograma de nómina configurado) en el tema de la base, y, automaticamente en enero, con los nuevos topes, te hayan revisado la base, pero no estoy muy seguro que, aun en siendo empresa colaboradora, eso sea así (en el caso que yo conozco no es así, pero ademas, aunque el coste total lo acabe asumiendo la empresa, desglosan prestación y complementos).
Ahora también entiendo como, estando de IT podías ver el desglose nromal de los distintos conceptos salariales, antes y después de la revisión por convenio.
En fin, comentalo si quieres a los de nóminas, si crees que te interesa, en rpincipio te están reteniendo más por cotizacines, pero también es cierto que respecto a futuras posibles prestaciones tu base sera mayor.
Un saludo