Por poder, puede, pero tiene que tener en cuenta dos cosas:
La primera: La solicitud, si la hace en España, ha de ser presentada antes de que empiece el último mes de estancia legal. Es decir si viene como turista, y tiene un permiso de estancia de turista de 3 meses, la solicitud la ha de presentar en la Oficina de Extranjería de la provincia donde se ubique el centro de estudios, en los dos primeros meses de estancia en España (si la presenta iniciado el tercer mes, obtendrá una resolución desfavorable).
La segunda: Normalmente el consulado deniega el visado en base a un informe desfavorable que, durante la tramitación del visado, hace la oficina de extranjeria de la provincia donde está el centro académico. Con lo que es probable que si le deniegan el visado en el consulado, y viene a España, la oficina de extranjería se la volverá a denegar (por la misma causa por la cual emitió el informe desfavorable). Moraleja: Si a su sobrina le deniegan el visado, y va a presentar la solicitud en España, que lo haga en otra oficina de extranjeria para estudiar en otra provincia.