Hola Alejandro:
Si tienes separación de bienes este es régimen que existirá hasta que se cambie, la vivienda será un pro indiviso ordinario, y las deuda, si no se ha especificado la parte de cada uno, será por mitad, así como su valor cuando se transmita.
Espero haber respondido a tus preguntas.
Yo tengo separacion de bienes pero despùes hemos pedido una hipoteca y hemos comprado una vivienda entre los dos, como estamos obligados a pagar la hipoteca a partes iguales y se puede considerar un bien ganancial ó pro indiviso.Tengo mis dudas al respecto gracias