El hecho de que un Alcalde construya con una licencia de reconstrucción caducada y contraviniendo las normas urbanísticas se puede considerar prevaricación o cohecho. En este caso la licencia es de reconstrucción y la nueva vivienda tiene una mayor superficie que la original así como una planta más.
El Alcalde como cualquier vecino, esta cometiendo una infraccion urbanistica grave por lo que puedes denunciar la obra como si la realizase cualquier vecino. Ademas el Alcalde tendra que abstenerse de intervenir en la resolucion del expediente de denuncia por ser parte interesada. No obstante por ser un caso especial, paralelamente denunciaria la obra en la Comunidad Autonoma a que corresponda el Ayuntamiento y que ejerza dicho control urbanistico.
No soy jurista, por lo que considero que solo responderia como cualquier vecino por el tema de infraccion urbanistica. Otro caso seria que el Alcalde haya tenido alguna actuacion en su propio expediente, en el que, por ley, tendria que estar obligado a abstenerse.