Si no hay emancipación legal sí, puedes tener problemas. Puedes esperarte a que sea mayor de edad, que se emancipe legalmente o dejarlo en custodia del padre.
Puedo irme al extranjero a trabajar y dejar a mi hija de 17 años sola en casa, ella no quiere venirse conmigo, ni mudarse con su padre. Por supuesto que yo seguiría asumiendo sus gastos y su abuela y su padre viven a unos 20 km y estarían pendientes de ella, ella tiene ilusión de quedarse viviendo sola, para mí es una oportunidad muy buena de trabajo y pienso que le vendría bien para empezar a tener el control de su vida, lo que no sé es si legalmente pueda tener algún problema.